CSVからDBにインポートする際に改行があり崩れたことがありました。そのときの解決方法です。

public function fgetcsv_reg (&$handle, $length = null, $d = ',', $e = '"') {
   $d = preg_quote($d);
   $e = preg_quote($e);
   $_line = "";
   $eof = false;
   while (($eof != true) and (!feof($handle))) {
       $_line .= (empty($length) ? fgets($handle) : fgets($handle, $length));
       $itemcnt = preg_match_all('/'.$e.'/', $_line, $dummy);
       if ($itemcnt % 2 == 0) $eof = true;
   }
   $_csv_line = preg_replace('/(?:\r\n|[\r\n])?$/', $d, trim($_line));
   $_csv_pattern = '/('.$e.'[^'.$e.']*(?:'.$e.$e.'[^'.$e.']*)*'.$e.'|[^'.$d.']*)'.$d.'/';
   preg_match_all($_csv_pattern, $_csv_line, $_csv_matches);
   $_csv_data = $_csv_matches[1];
   for($_csv_i=0;$_csv_i<count($_csv_data);$_csv_i++){
       $_csv_data[$_csv_i]=preg_replace('/^'.$e.'(.*)'.$e.'$/s','$1',$_csv_data[$_csv_i]);
       $_csv_data[$_csv_i]=str_replace($e.$e, $e, $_csv_data[$_csv_i]);
   }
   return empty($_line) ? false : $_csv_data;
}

$name = mb_convert_encoding($name,'SJIS','UTF-8');
  $filepath = './tmp/'.$name;
  $handle = fopen($filepath, "r");
  $records = array();
  while (($line = $this->fgetcsv_reg($handle)) !== false) {
   mb_convert_variables("UTF-8", "SJIS-WIN", $line);
   $records[] = $line;
  }